Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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