Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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