Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms