Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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