Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms