Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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