Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms