Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms