Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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