Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms