Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms