Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EP300Q09472 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms