Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms