Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms