Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF738-203ENST00000594245 1086 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms