Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms