Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms