Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms