Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2FP61218 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms