Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms