Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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