Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCA2P51587 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCA2P51587 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCA2P51587 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCA2P51587 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCA2P51587 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms