Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms