Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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