Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms