Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms