Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETSIPP0DME0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms