Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
O00370 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
O00370 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
O00370 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
O00370 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
O00370 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
O00370 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms