Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC1Q9Y5R8 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC1Q9Y5R8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC1Q9Y5R8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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