Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms