Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms