Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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