Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms