Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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