Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms