Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms