Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms