Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms