Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms