Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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