Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP2Q96PD5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms