Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms