Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms