Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms