Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms