Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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