Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms