Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms