Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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