Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD1Q5SYB0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms